Tesis Magister Teknik Airtanah diharapkan dapat menunjukkan kemampuan yang menyeluruh dalam membangun atau mengaplikasikan prinsip-prinsip dasar hidrogeologi. Sebelum memulai tesis para calon diharuskan mempersiapkan suatu usulan tesis (proposal) yang akan dinilai untuk disetujui oleh suatu panitia pembimbing yang akan dibentuk oleh sekretaris program berdasarkan segi mutu dan kemungkinan dapat diselesaikan pada waktu yang ditentukan. Para calon diharuskan mempertahankan tesisnya secara lisan di hadapan suatu sidang ujian tertutup yang dihadiri oleh para anggota staf pengajar Program Magister serta Panitia Pembimbing.